Fermentacijska komora je naprava ali prostor, namenjen fermentaciji oziroma vzhajanju živil. Takšne naprave se pogosto uporabljajo v pekarnah, pivovarnah ali restavracijah, kjer pripravljajo fermentirana živila, kot so kruh, jogurt, fermentirana zelenjava (na primer kislo zelje) ali pijače, kot sta pivo in vino.

Pri pekovskih izdelkih fermentacijska komora pod nadzorovano temperaturo in vlažnostjo optimizira proces vzhajanja testa. V pivovarnah in pri proizvodnji alkoholnih pijač se fermentacijska komora uporablja za fermentacijo, kjer mikroorganizmi (kot so kvasovke) pretvarjajo sladkorje v alkohol in druge spojine.

Vsaka specifična uporaba fermentacijske komore ima lahko posebne zahteve glede opreme in nastavitev, odvisno od vrste in stila fermentiranega izdelka, ki se proizvaja.